Các gen ở NST 17 Nhiễm sắc thể số 17

Số lượng gen

Sau đây là một số ước tính số lượng gen của NST 17. Bởi vì các nhà nghiên cứu sử dụng các phương pháp khác nhau để nghiên cứu và xác định, nên số lượng dự đoán của họ là khác nhau (để biết chi tiết kỹ thuật, xem dự đoán gen).[10]

Dự đoánGen cấu trúcGen không mã hoáGen giảNguồnNgày công bố
CCDS1,124——[2]2016-09-08
HGNC1,132325458[11]2017-05-12
Ensembl1,1841,199535[12]2017-03-29
UniProt1,169——[13]2018-02-28
NCBI1,199757566[14][15][16]2017-05-19

Danh sách các gen đã biết

Sau đây là danh sách một số các gen trên NST 17.

Vị trí tế bào học của một số gen

Vai p (p-arm)

  • FLCN: folliculin (17p11.2)
  • MYO15A: myosin XVA (17p11.2)
  • RAI1: retinoic acid induced 1 (17p11.2)
  • PMP22: peripheral myelin protein 22 (17p12)
  • CTNS: cystinosin, the lysosomal cystine transporter (17p13)
  • USP6: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6 linked to Aneurysmal bone cyst (17p13)
  • ACADVL: acyl-coenzyme A dehydrogenase, very long chain (17p13.1)
  • SHBG: Sex hormone binding globulin (17p13.1)
  • TP53: tumor suppressor protein p53 (Li-Fraumeni syndrome), tumor suppressor gene (17p13.1)
  • ASPA: aspartoacylase (Bệnh Canavan) (17p13.3)
  • GLOD4: glyoxalase domain containing 4 (17p13.3)

Vai q (q-arm)

  • CCDC55: Coiled-coil domain-containing protein 55 (17q11.2)
  • FLOT2: flotillin 2 (17q11.2)
  • NF1: neurofibromin 1 (neurofibromatosis, von Recklinghausen disease, Watson disease) (17q11.2)
  • SLC6A4: Serotonin transporter linked to Obsessive Compulsive Disorder (OCD) [17] (17q11.2)
  • CCL4L1: C-C motif chemokine ligand 4 like 1 (17q12)
  • DDX52: DExD-box helicase 52 (17q12)
  • ERBB2 loca leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) (17q12)
  • GRB7: Growth factor Receptor-Bound protein 7 (17q12)
  • BRCA1: breast cancer 1, early onset (17q21)
  • GFAP: glial fibrillary acidic protein (17q21)
  • RARA or RAR-alpha: Retinoic acid receptor Alpha (involved in t(15,17) with PML) (17q21)
  • MAPT gene coding for encoding tau protein (17q21.1)
  • NAGLU: N-acetyl glucosaminidase, Sanfilippo B syndrome (17q21.2)
  • SLC4A1: Band 3 anion transporter protein. Solute carrier family 4, member 1 (17q21.31)
  • CBX1: chromobox homolog 1 (17q21.32)
  • COL1A1: collagen, type I, alpha 1 (17q21.33)
  • LUC7L3: LUC7 like 3 pre-mRNA splicing factor (17q21.33)
  • NOG: Noggin protein (17q22)
  • RPS6KB1 or S6K: Ribosomal protein S6-kinase (17q23.1)
  • FTSJ3: FtsJ homolog 3 (17q23.3)
  • SCN4A: Voltage-Gated Sodium Channel Subunit Alpha Nav1.4 (17q23.3)
  • GALK1: galactokinase 1 (17q24)
  • KCNJ2: potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2 (17q24.3)
  • ACTG1: actin, gamma 1 (17q25)
  • CDC42EP4: CDC42 effector protein 4 (17q25.1)
  • USH1G: Usher syndrome 1G (autosomal recessive) (17q25.1)
  • CANT1: Calcium-activated nucleotidase 1 (17q25.3)
  • BIRC5: Survivin (17q25.3)
  • CHMP6: Charged multivesicular body protein 6 (17q25.3)
  • ENPP7: ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 (17q25.3)
  • EPR1: Effector cell peptidase receptor 1 (17q25.3
  • RHBDF2: Rhomboid family member 2 (17q25.3)
  • TMC6 và TMC8: Transmembrane channel-like 6 and 8 (epidermodysplasia verruciformis) (17q25.3)

Các băng G đã nhận biết

Các dải (băng) của NST 17 nhờ nhuộm băng G với độ phân giải 850 bphs.
NSTVai[18]Băng[19]ISCN

start[20]

ISCN

stop[20]

Cặp bp

bắt đầu

Cặp bp

kết thúc

Vết[21]Mật độ
17p13.30385&0000000000000001.0000001&0000000003400000.0000003.400.000gneg
17p13.2385550&0000000003400001.0000003.400.001&0000000006500000.0000006.500.000gpos50
17p13.1550784&0000000006500001.0000006.500.001&0000000010800000.00000010.800.000gneg
17p12784990&0000000010800001.00000010.800.001&0000000016100000.00000016.100.000gpos75
17p11.29901499&0000000016100001.00000016.100.001&0000000022700000.00000022.700.000gneg
17p11.114991664&0000000022700001.00000022.700.001&0000000025100000.00000025.100.000acen
17q11.116641815&0000000025100001.00000025.100.001&0000000027400000.00000027.400.000acen
17q11.218152104&0000000027400001.00000027.400.001&0000000033500000.00000033.500.000gneg
17q1221042255&0000000033500001.00000033.500.001&0000000039800000.00000039.800.000gpos50
17q21.122552461&0000000039800001.00000039.800.001&0000000040200000.00000040.200.000gneg
17q21.224612599&0000000040200001.00000040.200.001&0000000042800000.00000042.800.000gpos25
17q21.3125992874&0000000042800001.00000042.800.001&0000000046800000.00000046.800.000gneg
17q21.3228743025&0000000046800001.00000046.800.001&0000000049300000.00000049.300.000gpos25
17q21.3330253176&0000000049300001.00000049.300.001&0000000052100000.00000052.100.000gneg
17q2231763383&0000000052100001.00000052.100.001&0000000059500000.00000059.500.000gpos75
17q23.133833451&0000000059500001.00000059.500.001&0000000060200000.00000060.200.000gneg
17q23.234513658&0000000060200001.00000060.200.001&0000000063100000.00000063.100.000gpos75
17q23.336583781&0000000063100001.00000063.100.001&0000000064600000.00000064.600.000gneg
17q24.137813850&0000000064600001.00000064.600.001&0000000066200000.00000066.200.000gpos50
17q24.238504001&0000000066200001.00000066.200.001&0000000069100000.00000069.100.000gneg
17q24.340014166&0000000069100001.00000069.100.001&0000000072900000.00000072.900.000gpos75
17q25.141664400&0000000072900001.00000072.900.001&0000000076800000.00000076.800.000gneg
17q25.244004510&0000000076800001.00000076.800.001&0000000077200000.00000077.200.000gpos25
17q25.345104950&0000000077200001.00000077.200.001&0000000083257441.00000083.257.441gneg

Tài liệu tham khảo

WikiPedia: Nhiễm sắc thể số 17 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/gdp/ideogram_9606_G... ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/gdp/ideogram_9606_G... ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/gdp/ideogram_9606_G... http://ghr.nlm.nih.gov/chromosome=17 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2898077 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10464617 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20441615 http://web.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome... //dx.doi.org/10.1089%2Fgte.1998.2.357 //dx.doi.org/10.1109%2FJCSSE.2012.6261965